7月18日,美國國家航天航空局(NASA)將往國際空間站(ISS)運送下一批物資及科研設備,其中括含牛津大學(xué)的MinIon納米孔測序設備??臻g站的宇航員將利用其對**,病毒及小鼠的DNA進(jìn)行測序,并將這些數據將傳送回來(lái),與地球上測得的結果進(jìn)行比對。
MinIon納米孔測序儀
約翰遜航天中心的微生物學(xué)家Sarah Wallace認為,目前來(lái)說(shuō),MinIon是**一個(gè)可以放心在宇宙空間使用的測序儀。她告訴記者,儀器的大小是它的優(yōu)勢之一,而且和Illumina以及Sanger法測序儀器不同的是,MinIon對于震動(dòng)不敏感,另外耗電量也較小。
雖然,人們想對更多的微生物進(jìn)行測序,但是MinIon在微重力的環(huán)境下工作的可靠性還需要進(jìn)行確認。其中一個(gè)擔憂(yōu)是樣品放入機器時(shí)會(huì )產(chǎn)生氣泡,雖然這在地球上并不是什么大問(wèn)題。放置樣本的這一過(guò)程設計需要考慮到與航空工作環(huán)境相兼容。NASA還希望該系統可以滿(mǎn)足在ISS上分析測序數據的需求。
Wallace希望MinIon在ISS的研究可以為地球上的研究者所用。ISS作為一個(gè)國際性的實(shí)驗室, 如果這項研究可以進(jìn)行, 那么該研究成果可以與整個(gè)學(xué)術(shù)界共享。
MinIon測序儀的其它應用
MinIon測序儀還有其他應用,Wallace的同事Aaron Burton一直在嘗試著(zhù)使用MinIon來(lái)探測其它星球。因為它與其它測序儀完全不同的工作機制,它可以主動(dòng)尋找DNA,RNA和蛋白質(zhì),如果對納米孔進(jìn)行修飾,也許可以通過(guò)它來(lái)尋找不同種類(lèi)的核酸。
Burton 說(shuō):“在我所了解的技術(shù)中,這是**一個(gè)可以用來(lái)尋找未知的儀器,我可以利用它找出一個(gè)樣本中所有的**,而不像PCR,我需要知道特異性的引物,然后去尋找已知的序列。這項技術(shù)剛好滿(mǎn)足了我們尋找未知序列的要求?!?
NASA工作計劃
NASA計劃于7月18日將MinIon運往NASA極端環(huán)境任務(wù)操作間(NEEMO),這是一個(gè)水下工作站,位于弗羅里達Key Largo海岸線(xiàn)上。在這個(gè)模擬的宇宙工作站中,研究者和工程師也會(huì )進(jìn)行同樣的測序實(shí)驗。其余科學(xué)家已經(jīng)為在宇宙空間站的實(shí)驗做好準備,確保儀器在空間站的工作與在地球一樣。
Bruce Hammer是明尼蘇達州中心大學(xué)磁共振研究所的教授,他曾建議開(kāi)展針微重力環(huán)境下骨小體的組學(xué)研究。在NASA的電話(huà)會(huì )議上Hammer教授說(shuō),他們將會(huì )對7月18日運送到ISS的骨小體樣本進(jìn)行基因表達,蛋白表達,兩種表達之間的關(guān)系以及骨小體新城代謝水平的研究。這項研究預計將于九十月份開(kāi)始,宇航員會(huì )先解凍這些細胞。一旦該實(shí)驗開(kāi)始,他和他的同事將會(huì )對在ISS上得到的數據與地球上模擬微重力環(huán)境下得到的數據進(jìn)行對比。